С помощью плагина WorldEdit для Bukkit вы сможете на много быстрее редактировать карту сервера.
Установка:
Извлечь архив "WorldEdit.rar"
Архив "WorldEdit-1.7.4.jar (1.7.9/1.7.2)" или "WorldEdit-1.6.4.jar(1.7.5)" или "WorldEdit-1.5.2.jar" - в зависимости от версии вашего сервера - перенести в plugins/